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梅谷直亨

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ブラウザだけで Table 1 (サマリー表、患者背景) を爆速で作る

投稿者プロフィール
梅谷直亨

河北総合病院

7,365

57

投稿した先生からのメッセージ

皆様の学会・論文の準備が少しでも楽になることを願っています。

概要

学会発表や論文で必要になる Table 1 (サマリー表、患者背景) を準備するのは意外と大変です。

このスライドでは、新しく公開された ブラウザだけで使える無料統計ソフト Reactive stat を使って爆速で作る方法をお伝えします。

データファイルさえあれば、本当にあっという間に作れて、そのまま原稿に貼り付けることができます。

本スライドの対象者

医学生/研修医/専攻医/専門医

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テキスト全文

  • #1.

    Table 1 を爆速で作る (サマリー表、患者背景) <会社名>が売上を XX% 増加させた方法

  • #2.

    学会発表や論文で必要になる Table 1 (サマリー表、患者背景 ) 皆さんはどうやって作っていますか?

  • #3.

    Table 1 の例 このような表を準備するのは意外と大変です。 統計ソフトの R には TableOne というパッケージがあ り、EZR からも呼び出せますので、それを使う方も多 いと思います (私もそうでした)。 このスライドでは、新しく公開されたブラウザだけで 使える無料統計ソフト Reactive stat を使って爆速で 作る方法をお伝えします。 データファイルさえあれば、本当にあっという間に作 れて、そのまま原稿に貼り付けることができます。 インストール不要 1分以内に作れます

  • #4.

    ブラウザだけで使える 無料統計ソフト Reactive stat ブラウザからアクセスするだけで使え、データ以 外は何の準備もいりません。 共用のPCでも、スマホからでも使えます。 信頼性の高い R で統計解析し、その結果をAI が解説します。 サマリー表 (いわゆる Table1) 作成機能が充実 しています。 https://www.emuyn.net/stats

  • #5.

    サマリー表の作成 (Table One) 当該ページにアクセスしたら、 を押して、お試しデータをロードします。 もちろん、ご自分の CSV やエクセルファイルも読 み込めます。 数値計算以外はブラウザ内で完結するので、生 データをサーバーに送信することはなく、個人情 報の漏洩の心配はありません。 https://www.emuyn.net/stats/table_one

  • #6.

    用意されているサンプルは 乳がん患者のデータです とっつきやすいように、カラム名とデータ内容が 日本語に翻訳されていますね。 海外製のツールだとしばしば日本語データがエ ラーになったり文字化けしたりしますが、完全日 本語対応なので気楽です。

  • #7.

    表示された Table 1 を とりあえずお示しします 設定項目の下には、すでに表 ができています。 p値も計算されていますが、こ れはクラウドの R で計算してい るとのことです。 ちなみに、スマホでもできまし た。もちろんタブレットも OK

  • #8.

    「設定」セクションに、表作成 の設定項目が並びます 設定項目に戻ってください。項目を適当にいじってみる と、出力される表がリアルタイムに変化します。これが “reactive” という名前の所以です。 青緑色のボタンは “ON” 淡灰色のボタンは “OFF” 矢印は “ドラッグして入れ替え可能” 連続変数と、群分類のカテゴリカル変数に はミニヒストグラムが表示されます。

  • #9.

    表の右側にも設定項目が並 びます いろいろ設定できますので、大概の用途には対 応できると思います。 枠線の設定はないので、必要に応じてエクセル にコピペしてから変更します。 脚注記号は論文の投稿先の規定に合わせてく ださい。 p値の計算に使用された R は常に最新です。 記事作成時点では、 R version 4.4.0 (2024-04-24) となっていました。

  • #10.

    出力された表の利用 文字情報を含むデータとして利用する場合 後で内容やレイアウトを編集することができま す。 画像として表示する場合 編集できない代わりにレイアウトが崩れる心配 がありません。

  • #11.

    「通常形式」でコピーしてパ ワーポイントに貼り付けた場合 貼り付けるとそのまま表として扱われます。 ちなみに、クリップボードの内容は単純なタブ区 切りテキストです。

  • #12.

    「エクセル用」でコピーしてエ クセルに貼り付けた場合 完成した表をエクセルに貼り付けるには、表の 下にあるこのボタンを押してください。 その際、必ず「エクセル用」を選んでください 。 フォーマットが崩れないような細工がしてありま す。

  • #13.

    「通常形式」でコピーして エクセルに貼り付けた場合 エクセルなど表計算ソフトでは、( ) 内の数値を 貼付時に勝手にマイナスに変換します。 例: (36.4) → -36.4 ですので、せっかくのフォーマットが崩れてしま います。 エクセルはこのようなおせっかい機能が多い ので個人的には嫌いです。 論文の原稿を作るときにはこのような罠に嵌ら ないように気を付けましょう。

  • #14.

    「HTML形式」でコピーして table.html に保存し、ブラウ ザで開いた場合 HTML形式は、ウェブページの記述用のフォーマット です。 MarkDown 原稿にそのまま貼り付けて使用すること もできます。

  • #15.

    「表の全体イメージを表示」から 画像として利用 画像であれば、フォーマットが崩れること がなく、学会発表でのスライドには便利で す。 論文の原稿には使わないほうがいいで す。 ファイル名と形式 (png, jpg, webp から選 択) を指定してダウンロードします。 キャンパスサイズは拡大縮小できます。

  • #16.

    EZR でもやってみます

  • #17.

    同じデータを使って、EZR でも サマリー表を作ってみました 筆者はもともと EZR をインストー ルしてあったので簡単に使えま す。 データを読み込んだら、「グラフ と表」の「サンプルの背景データ のサマリー表の出力」を選択し ます。 あとは、対象となる変数を選択 して 「OK」

  • #18.

    EZR のサマリー表の出力 R コマンダーのウィンドウに、出力内容が表示さ れます。 この時点で、すでにクリップボード内に表データ が入っているので、あとはエクセルに貼り付ける だけ。 プログラムが走ってますって感じでかっこいいで すね。これを使いやすくしたのがEZR。素晴らし い!

  • #19.

    EZR のサマリー表をエクセ ルに貼り付けるとこんな感じ きれいな表が出力されています。 p値の計算方法は、「自動判定」で設定したので すが、たぶん全てカイ二乗検定と思います。 R の version はR コマンダーのスクリプトに以下 を入れて実行すれば取得できます。 version <- R.Version() cat(version$version.string) R version 4.3.1 (2023-06-16 ucrt) でした。

  • #20.

    皆様の学会・論文の準備が少しでも 楽になることを願っています。 Enjoy!

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